برنامه استراتژیک پنج ساله پژوهشکده
در این متن منظور از پژوهشکده، پژوهشکده علوم پایه پزشکی می‌باشد. بدیهی است حصول به اهداف این برنامه مستلزم حمایت مالی و سازمانی مؤثر از سوی معاونت تحقیقات و فناوری دانشگاه و وزارت متبوع است.

سال اول

الف): کسب مجوز نهایی تأسیس پژوهشکده از مراجع ذی‌صلاح ( وزارت متبوع و دانشگاه).
ب): تصویب چارت سازمانی پژوهشکده و استخدام نیروی انسانی لازم اعم از بخش‌های ستادی، فنی، علمی و اداری با تخصص‌های مورد نظرجهت نیل به اهداف تعریف‌شده پژوهشکده.
ج): جذب و تخصیص بودجه مستقل و تفویض اختیار مالی و متناسب با اهداف و برنامه های پژوهشکده از بخش دولتی (وزارت متبوع)، خیرین حوزه سلامت، سایر نهادها و شرکت‌های داخلی و بین المللی.
د): تفویض اختیار مالی تام به رئیس پژوهشکده جهت انجام امور پژوهشکده.

سال دوم

الف): احداث و توسعه فضای فیزیکی متناسب با اهداف، فعالیت‌ها و برنامه‌های پژوهشکده.
ب): خریداری تجهیزات متناسب با اهداف و برنامه‌های پژوهشکده و ایجاد بستر مناسب جهت انجام پروژه‌های تحقیقاتی جهت تولید دانش و محصولات دانش‌بنیان در حوزه علوم پزشکی و بهداشت.
ج): تأسیس، گسترش و تجهیز آزمایشگاه‌های مراکز تابعه پژوهشکده.
د): برنامه‌ریزی جهت مشارکت بیشتر اعضای هیأت علمی در انجام طرح‌های تحقیقاتی.
ر): تقویت شورای پژوهشی پژوهشکده.
ز): دعوت از پژوهشگران ایرانی مقیم و غیر‌مقیم یا پژوهشگران ممتاز غیرایرانی جهت سخنرانی، برگزاری کارگاه و انجام فعالیت‌های پژوهشی مشترک در پژوهشکده.

سال سوم

الف): فراهم کردن زیرساخت‌های لازم جهت توسعه تحصیلات تکمیلی از لحاظ تنوع رشته و تعداد دانشجو در مقاطع کارشناسی ارشد، دکتری و پسادکترای پژوهشی.
ب): فراهم کردن زیرساخت‌ها و فراساختارهای لازم جهت رساندن تعداد مقالات Q1 پژوهشکده به حد اقل ۱۰ مقاله در سال (آموزشی- پژوهشی).

سال چهارم

الف): تأسیس و ثبت حداقل یک شرکت دانش‌بنیان وابسته به پژوهشکده.
ب): فراهم کردن زیرساخت و فراساخت‌های لازم جهت ارائه خدمات تخصصی به سایرافراد، سازمان‌ها و نهادهای دولتی و خصوصی.

سال پنجم

الف): فراهم کردن زیرساخت و فرا‌ساخت های لازم جهت همکاری پژوهشکده با صنعت در جهت اجرای طرح‌های تحقیقاتی کاربری به منظور تولید نیازهای بخش صنعت و نیز تجهیزات تحقیقاتی، پزشکی و دارویی مانند دارو و کیت‌های تشخیص آزمایشگاهی و سایر ملزومات صنعتی-پزشکی.
ب): فراهم کردن زیرساخت و فراساخت‌های لازم جهت کاربردی نتایج تحقیقات پژوهشکده برای تولید محصول و ارائه خدمات تخصصی.